Cơ cấu tổ chức của Ủy ban nhân dân xã Lộc Yên gồm: 

- Chủ tịch Ủy ban nhân dân xã: ông Hứa Văn Thành

- Phó chủ tịch Ủy ban nhân dân xã: ông Lộc Văn Tá

- Ủy viên Ủy ban nhân dân xã: 

+ Ủy viên phụ trách Công an: ông Phùng Mạnh Thu - Trưởng Công an xã 

+ Ủy viên phụ trách Quân sự: ông Lành Văn Thường - Chỉ huy trưởng BCHQS xã.